| 2024年09月 | 協和麒麟（中国）製薬有限公司の全株式をHong Kong WinHealth Pharma社に譲渡 |
| 2024年01月 | 英国のOrchard Therapeutics plc（現 Orchard Therapeutics Limited）の全株式を取得し完全子会社化 |
| 2022年04月 | 東京証券取引所の市場区分見直しに伴い東京証券取引所市場第一部からプライム市場に移行 |
| 2019年07月 | 商号を協和発酵キリン(株)から協和キリン(株)に変更 |
| 2019年04月 | 協和発酵バイオ(株)の株式の95％をキリンホールディングス(株)に譲渡（2023年１月に全残余持分を譲渡） |
| 2018年04月 | X染色体連鎖性低リン血症治療剤「Crysvita」を米国で発売 |
| 2018年01月 | 協和メデックス(株)の株式の66.6％を日立化成(株)に譲渡（2021年４月に全残余持分を譲渡） |
| 2014年08月 | 英国のArchimedes Pharma Limitedの全株式を取得し完全子会社化 |
| 2012年03月 | 富士フイルム(株)との合弁会社協和キリン富士フイルムバイオロジクス(株)（バイオシミラー医薬品の開発・製造・販売）を設立 |
| 2011年04月 | 英国のProStrakan Group plc（現 Kyowa Kirin International plc）の全株式を取得し完全子会社化 |
| 2011年03月 | 協和発酵ケミカル(株)の全株式をケイジェイホールディングス(株)に譲渡 |
| 2011年01月 | キリン協和フーズ(株)の全株式をキリンホールディングス(株)に譲渡 |
| 2008年10月 | バイオケミカル事業を新設分割し、協和発酵バイオ(株)を設立 キリンファーマ(株)を吸収合併し、商号を協和醱酵工業(株)から協和発酵キリン(株)に変更 |
| 2008年04月 | 株式交換によりキリンファーマ(株)が当社の完全子会社となり、キリンホールディングス(株)が当社の発行済株式総数の50.1％を保有する親会社となる また、キリンファーマ(株)の子会社である麒麟鯤鵬(中国)生物薬業有限公司（後の協和麒麟(中国)製薬有限公司）、第一・キリン薬品(株)（現 韓国協和キリン(株)）、麒麟薬品股份有限公司（現 台灣協和麒麟股份有限公司）他が当社の連結子会社となる |
| 2005年04月 | 食品事業を新設分割し、協和発酵フーズ(株)（後のキリン協和フーズ(株)）を設立 |
| 2004年04月 | 化学品事業を協和油化(株)に分割承継し、協和油化(株)は商号を協和発酵ケミカル(株)に変更 |
| 2003年02月 | 米国にBioWa, Inc.を設立 |
| 2002年09月 | 酒類事業をアサヒビール(株)に譲渡 |
| 1992年10月 | 米国にKyowa Pharmaceutical, Inc.（現 Kyowa Kirin, Inc.）を設立 |
| 1981年04月 | 協和メデックス(株)を設立 |
| 1959年09月 | 抗悪性腫瘍剤「マイトマイシン」を発売 |
| 1956年09月 | 発酵法によるグルタミン酸ソーダ製造法の発明とその企業化を公表 |
| 1951年04月 | 米国のメルク社から「ストレプトマイシン」の製造技術を導入 |
| 1949年08月 | 当社株式を東京証券取引所に上場 |
| 1949年07月 | 企業再建整備法に基づき、協和産業(株)を解散し、その第二会社協和醱酵工業(株)（資本金5,000万円）を設立 |